Huopakattoa tulisi huoltaa ja tarkistaa säännöllisesti, kuten muitakin katemateriaaleja. Huopakaton huollot ja tarkastukset tehdään yleensä syksyllä ennen talven tuloa ja keväällä, kun lumet ovat lähteneet.
Huopakaton huoltoon kuuluu huopakaton tarkastus, jossa tarkastetaan myös hitsaussaumat ja ylösnostot. Samalla tarkistetaan kattoturvat, läpiviennit ja pellitykset. Tarkastuksen yhteydessä katto ja kattokaivot puhdistetaan irtoroskista sekä hoidetaan mahdolliset korjaukset. Kevyen perushuollon yhteydessä seurataan onko katolle ilmestynyt kasvustoa. Mikäli katolle on alkanut kasvaa sammalta, suositellaan suoritettavaksi huopakaton puhdistus tai huopakaton pesu.
